Margarita Alvarado comienza sus estudios en Diseño de Interiores y Muebles, lo que más tarde complementa con sus estudios de Estética en la Pontificia Universidad Católica de Chile (PUC), generando una nueva propuesta en su investigación personal. Actualmente  se desempeña como Profesora e Investigadora del Instituto de Estética de la PUC, y continúa  sus estudios en el Doctorado de Estudios Latinoamericanos de la Universidad de Chile.

Es miembro fundadora de la Red de Investigación de la Imagen Fotográfica, RIIF UC, creada al alero del  Instituto de Estética, Pontificia Universidad Católica de Chile.

En relación a su actividad como investigadora, los últimos 15 años ha encabezado un equipo multidisciplinario de Estetas, Antropólogos e Historiadores, realizando  investigaciones sobre representación e interpretación de imágenes fotográficas de los indígenas del sur de América.

Paralelamente ha trabajo en el ámbito de las representaciones y los imaginarios de los pueblos indígenas americanos, complementando metodologías propias de la estética y la antropología visual, especialmente en cuanto a la fotografía etnográfica, documental y de autor, tanto patrimonial como contemporánea.